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Las  reservas naturales de Puerto Rico son áreas cuyas características físicas, geográficas y ecológicas son identificadas por el Departamento de Recursos Naturales y Ambientales como áreas de importancia para proteger y las mismas se designan como Reserva Natural por la Junta de Planificación de Puerto Rico.

El Estuario o Caño Boquilla de Mayagüez fue designado como reserva natural en el año 2002. Esta reserva comprende 120 cuerdas de terreno de dominio público y se extiende desde Punta Algarrobo en el Municipio de Mayagüez, hasta el Caño La Puente en el Municipio de Añasco, incluyendo la desembocadura del Río Grande de Añasco. Además incluye las 9 millas náuticas de mar territorial frente a toda la extensión de la zona marítimo terrestre de la Reserva.

Esta designación se logró con el fin de proteger, conservar y proveer oportunidades de educación e investigación en dicho ecosistema. El Estuario Boquilla y los bosques de mangle asociados son ecosistemas de relativa gran abundancia en Puerto Rico. Los estuarios son zonas de transición entre el agua dulce y el agua salada y es un hábitat donde predominan los mangles, entre ellos: el Mangle Rojo, seguido por el Mangle Negro y el Mangle Blanco. Estos bosques de mangle bordean la zona costanera a lo largo de los estuarios, como es el caso de la Reserva Natural Boquilla y proveen hábitat para una gran diversidad de especies de vida silvestre, a veces únicas del lugar.

Otro tipo particular de humedal que podemos encontrar en la Reserva Natural Boquilla es el Bosque de Palo de Pollo. Estos ecosistemas son raros en la actualidad debido al impacto negativo de las actividades humanas sobre sus poblaciones. Estos árboles toleran poca salinidad y pueden crecer solos o mezclados con otros árboles y arbustos en los ecosistemas salobres del estuario. Incluso pueden formar pantanos tierra adentro llamados Bosques Húmedos. En las pocas áreas en Puerto Rico donde todavía podemos apreciar la majestuosidad y belleza del árbol Palo de Pollo o Pterocarpus officinalis es en la Reserva Natural Boquilla de Mayagüez, Primera Reserva Natural Costera de la Ciudad de Mayagüez.

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